creativemolecules DSS-H12/D12 說(shuō)明書(shū)
DSS-H12/D12
= H-DSS-H12 X = D-DSS-D12產(chǎn)品信息DSS-H12/D12二琥珀酰亞胺基亞丁酸酯12 x 1 mg的1:1摩爾比混合物(DSS-H12和DSS-D12
目錄號(hào):編號(hào):creativemolecules 001S
分子式:C16H20N2O8/C16D12H8N2O8
分子量:368/380特征:同位素編碼。
膜滲透性。
用于死端交聯(lián)的240/252銨離子。
DSS-H12/D12是一種膜滲透性、同雙功能、同位素編碼的交聯(lián)劑二琥珀酰亞胺基丁二酸酯。試劑的輕(H12)和重(D12)形式的區(qū)別在于重形式的12個(gè)氘原子,而不是輕形式的12個(gè)氫原子,否則在化學(xué)上是相同的。同位素編碼能夠在質(zhì)譜中明確檢測(cè)交聯(lián)產(chǎn)物。
DSS-H12/D12的反應(yīng)產(chǎn)物將在質(zhì)譜中表現(xiàn)為強(qiáng)度相等的雙峰,對(duì)應(yīng)于試劑的輕(H12)和重(D12)形式,以12.07573 Da除以電荷狀態(tài)(+ 1為12.07,+ 2為6.04,+ 3為4.03等)。
在pH 7-9緩沖液中,N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)酯主要與伯氨基(-NH2)反應(yīng),形成穩(wěn)定的酰胺鍵。因此,交聯(lián)反應(yīng)應(yīng)避免使用含胺的緩沖液(Tris、甘氨酸、銨鹽等)。
DSS不溶于水,應(yīng)在有機(jī)溶劑(如DMSO或DMF)中制備貯備液,然后加入水性反應(yīng)混合物中。為制備50 mM DSS-H12/D12儲(chǔ)備液,向含有1 mg試劑的預(yù)稱(chēng)重管中加入53 μL DMSO。
使用以下公式計(jì)算肽交聯(lián)質(zhì)量:[M12 + H]+ =[M1 + H]+ +[M2 + H]+ + 137.06025[M1OH + H]+ =[M1 + H]+ + 156.07864[M1i + H]+ =[M1 + H]+ + + 138.06808[M1NH2 + H]+ =[M1 + H]+ + + 155.09462,其中M1、M2-游離肽質(zhì)量;M12-肽間交聯(lián)質(zhì)量;M1OH-死端交聯(lián)質(zhì)量;M1i–肽內(nèi)交聯(lián)的質(zhì)量;M1NH2–死端酰胺的質(zhì)量(如果用銨鹽淬滅反應(yīng))。
MS-Bridge)橋元素組成:C8 H10 O2;–OH死角的修飾元素組成:C8 H12 O3;–NH2死角的修飾元素組成:C8 H13 O2 N。
FLAG(DYKDDDDK)肽測(cè)試反應(yīng)的典型MALDI質(zhì)譜圖如圖1所示。試劑的輕(H12)形式的反應(yīng)產(chǎn)物的質(zhì)量為:1013–無(wú)FLAG肽;1151–肽內(nèi)交聯(lián);1169–死端交聯(lián);2163–肽間交聯(lián)。
MSMS光譜中對(duì)應(yīng)于試劑賴(lài)氨酸銨離子修飾的240/252雙峰信號(hào)表明存在–OH死端交聯(lián)(參考文獻(xiàn)1)。1、2)、(圖2)。
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