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firebirdbio自回避分子識別系統(tǒng)

更新時間:2020-05-22      點擊次數(shù):2285

firebirdbio自回避分子識別系統(tǒng)(SAMRS 

核酸擴增反應遭受脫靶擴增產(chǎn)物的形成。該問題隨著反應中引物的數(shù)量而增加,并且主要由于引物-引物相互作用而發(fā)生。因此,從引物堿基中選擇性除去氫鍵合單元會導致產(chǎn)生自我逃避的DNA引物,可以添加這些引物以實現(xiàn)和改善多重PCR。

 

如下所示,帶*的SAMRS堿基可以與標準堿基(在靶標或擴增子中)成對,但不能與其他SAMRS堿基成對。

            
                                    

 自回避分子識別系統(tǒng)-SAMRS TM
亞磷酰胺和寡核苷酸

 

 

T* phosphoramidite
1g$1050
10g$8220
A* phosphoramidite
1g$655
10g$5340
C* phosphoramidite
1g$394
10g$3150
G* phosphoramidite
1g$110
10g$880

 

 

含有SAMRS的寡核苷酸:

 

將SAMRS堿基放入PCR和其他擴增技術所用引物中的一般規(guī)則。大寫字母表示標準基數(shù),小寫字母表示SAMRS基數(shù)。 

 

  • 建議長度為20-35 nts。SAMRS堿基應在寡核苷酸3'末端的前4至5個位置使用,而不是在前面的3'堿基中使用。
  • 每個寡核苷酸應使用兩個至四個SAMRS堿基,優(yōu)選兩個或三個SAMRS修飾。
  • SAMRS t堿基在引物二聚體的形成方面沒有顯示出太多的減少,因此在選擇時好用a,g或c代替t。
  • 避免在由三個和四個連續(xù)相同的堿基組成的字符串中使用SAMRS堿基。例如:應避免使用ggg,ccc,aaa,ttt,gggg,cccc,aaa和tttt。
  • SAMRS堿基與標準堿基分開,例如:gGg,cCc,aaAA和tTt。
  • 如果寡核苷酸的3'末端為標準A或T,則第二個堿基也應為標準堿基,然后進行兩個或三個SAMRS修飾。

 

Firebird還準備SAMRS寡核苷酸文庫。

SAMRS可以在寡核苷酸中與AEGIS結合使用,以實現(xiàn)高度復用和高度清潔的PCR和等溫擴增。請咨詢。

 

與所有引物設計一樣,F(xiàn)irebird無法保證遵循這些規(guī)則制成的寡核苷酸的性能。

 

Benner等人,2015;Glushakova et al。,2015a,2015b; Hoshika et al。,2010; Sharma等,2014;Yang等人,2015年和未發(fā)布的數(shù)據(jù)

 

 

T* phosphoramidite
1g$1050
10g$8220
A* phosphoramidite
1g$655
10g$5340
C* phosphoramidite
1g$394
10g$3150
G* phosphoramidite
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